Pri vyšetrení chrupu pod operačným mikroskopom môžeme rozoznať i miniatúrne kazy, ktoré niekedy nie sú zistiteľné ani röntgenovým vyšetrením. Môžeme taktiež zistiť mikrošpáry u nedokonale zhotovených výplní, koruniek, včas diagnostikovať fraktúry a infrakcie (praskliny) zubov, ktoré sú často príčinou inak nezistiteľnej citlivosti. Operačný mikroskop nám môže pomôcť aj pri diagnostike ochorenia slizníc a ďasien.